Su regreso a Estambul llenó de alegría y satisfacción tanto a los eruditos como al pueblo. Sin previo aviso, fue designado como miembro del “Consejo de Sabiduría Islámica”, una institución que en ese entonces funcionaba como una academia islámica compuesta por destacados eruditos del Islam como Mehmed Akif, Izmirli Ismail Hakkı y Elmalılı Hamdi.
Su sobrino y discípulo espiritual, el muy inteligente, valiente y devoto erudito Abdurrahman (Rahmetullahi Aleyh), relata lo siguiente:
"En el año 1334 (1918), después de regresar del cautiverio, mi tío fue nombrado miembro del Consejo de Sabiduría Islámica sin su consentimiento. Sin embargo, debido al impacto que sufrió durante el cautiverio, no pudo asumir su cargo durante algún tiempo con permiso. Intentó renunciar en repetidas ocasiones, pero sus amigos no se lo permitieron. Finalmente, comenzó a asistir regularmente al Consejo de Sabiduría Islámica. Observé que, en su vida cotidiana, no gastaba más de lo estrictamente necesario. A quienes les preguntaban por qué vivía de manera tan modesta, les respondía:
'Quiero seguir al gran grupo (sevâd‑ı âzam). El gran grupo puede permitirse vivir así. No deseo seguir el ejemplo de la minoría derrochadora'.
Del salario que recibía en el Consejo de Sabiduría Islámica, apartaba lo indispensable para su sustento y me entregaba el resto diciéndome: '¡Guárdalo!'. Durante un año, confiando en su afecto hacia mí y en su actitud de desprecio hacia los bienes materiales, gasté todo el dinero acumulado sin su conocimiento. Luego me dijo:
'Ese dinero no era lícito para nosotros; pertenecía al pueblo. ¿Por qué lo gastaste? Dado que es así, te destituiré como administrador y me designaré a mí mismo'.
Pasó algún tiempo y sintió la necesidad de publicar doce de sus obras de las verdades islámicas. Utilizó el dinero que había acumulado del salario para financiar la impresión de estas obras. Excepto por una o dos pequeñas publicaciones, distribuyó el resto gratuitamente. Le pregunté por qué no las había vendido, y me respondió:
'Del salario solo me corresponde el sustento mínimo necesario; el resto pertenece al pueblo. De esta manera, lo devuelvo al pueblo'.
Su servicio en el Consejo de Sabiduría Islámica fue siempre personal e independiente. Porque encontraba algunos obstáculos para trabajar colectivamente en esa institución. Quienes lo conocían sabían que Bediüzzaman llevaba su mortaja alrededor del cuello y estaba dispuesto a enfrentar la muerte. Por eso, permaneció firme en el Consejo de Sabiduría Islámica como si fuera de hierro. Las influencias extranjeras no lograron utilizar el Consejo de Sabiduría Islámica como herramienta. Luchó valientemente contra las fatwas equivocadas. Siempre que surgía una corriente perjudicial para el Islam, publicaba obras para combatirla."